Новое исследование: определение потенциальных целей для лекарств, которые могут работать против всех коронавирусов.

Лекарства часто связываются внутри карманов с белками, которые плотно удерживают лекарство, что нарушает функцию белка. Ученые могут идентифицировать потенциальные карманы для связывания лекарств по трехмерным структурам вирусных белков.

Они сообщили о своих открытиях в журнале Proteome Research Американского химического общества.

Возможное появление вакцин-устойчивых вариантов SARS-CoV-2, а также новых коронавирусов делает важным поиск методов лечения, которые работают против всех коронавирусов.

Теперь исследователи проанализировали вирусные белки 27 видов коронавирусов и тысячи образцов от пациентов с Covid-19, выявив высококонсервативные последовательности, которые могут стать лучшими мишенями для лекарств. Они сообщили о своих открытиях в журнале Proteome Research Американского химического общества.

Лекарства часто связываются внутри карманов с белками, которые плотно удерживают лекарство, что нарушает функцию белка. Ученые могут идентифицировать потенциальные карманы для связывания лекарств по трехмерным структурам вирусных белков. Однако со временем вирусы могут видоизменить свои белковые карманы, и лекарства больше не подходят.

Но некоторые карманы, связывающие лекарство, настолько важны для функции белка, что они не могут подвергаться мутации, и эти последовательности обычно сохраняются с течением времени в одном и том же вирусе и в родственных вирусах.

Американское химическое общество заявило, что в своем исследовании исследователь Матье Шапира и его коллеги хотели найти наиболее консервативные карманы для связывания лекарств в вирусных белках из образцов пациентов с Covid-19 и из других коронавирусов. в пресс-релизе, посвященном исследованию.

Команда использовала компьютерный алгоритм для определения карманов связывания лекарств в трехмерных структурах 15 белков SARS-CoV-2. Затем исследователи обнаружили соответствующие белки у 27 видов коронавирусов и сравнили их последовательности в карманах, связывающих лекарства.

Два наиболее консервативных сайта, пригодных для применения лекарств, включают белки (называемые nsp13 и nsp12 соответственно), которые участвуют в репликации и транскрипции вирусной РНК.

Исследователи заявили, что новые противовирусные препараты, нацеленные на каталитический сайт белка nsp12, в настоящее время проходят фазы II и III клинических испытаний на Covid-19, и что сайт связывания РНК nsp13 является ранее малоизученной мишенью, которая должна быть высокоприоритетной для разработки лекарств. .

Источник: Американское химическое общество.

ПОДЕЛИТЕСЬ С ДРУЗЬЯМИ: