Объяснение: вариант B.1.617 и всплеск Covid-19 в Индии.
Данные секвенирования генома представили доказательства «двойного мутанта» в 61% образцов в Махараштре. Но вопрос о том, способствует ли этот новый вариант продолжающемуся росту Индии, можно будет сказать только после того, как появятся дополнительные данные.
Медицинские работники готовят койки в банкетном зале Shehnai в Нью-Дели, который был преобразован во временную палату для пациентов с Covid-9. (Экспресс-фото: Амит Мехра) Во время встречи с окружными лабораториями в Махараштре на прошлой неделе Национальный институт вирусологии (NIV) поделился ограниченными данными, показывающими разбивку 361 пробы с секвенированием генома, собранных в период с января по март этого года.
Заголовок находки из Анализ : наличие двойной мутации было обнаружено в 220 - почти 61% - образцах. Этот двойной вариант на прошлой неделе был классифицирован как вариант B.1.617.
Новостная рассылка| Нажмите, чтобы получать лучшие объяснения дня на свой почтовый ящик
Что такое B.1.617?
Вариант SARS-CoV-2 B.1.617 несет две мутации: E484Q и L452R. Оба по отдельности обнаруживаются во многих других вариантах коронавируса, но впервые в Индии они были зарегистрированы вместе.
Две мутации обнаружены в белке шипа вируса. Белок-спайк помогает вирусу связываться с рецепторами клетки человека и проникать в клетку-хозяин.
Мутация E484Q аналогична E484K, мутации, обнаруженной в вариантах коронавируса в Соединенном Королевстве (линия B.1.1.7) и Южной Африке (B.1.351).
Мутация L452R была обнаружена в быстро распространяющихся вариантах в Калифорнии (B.1.427 и B.1.429). Он может увеличивать связывающую способность белков-шипов с рецепторами ACE2 на клетках человека, делая его более передаваемым. L452R также может потенциально усиливать репликацию вируса.
Вместе E484Q и L452R более заразны и могут ускользать от антител.
Где был найден B.1.617?
Данные ограничены. Впервые об этом сообщили из Махараштры. В январе секвенировали 19 проб из разных районов, в четырех был обнаружен B.1.617. В феврале было секвенировано 234 образца из 18 районов, и 151 образец - как минимум из 16 районов - имел этот вариант. А в марте он был у 65 из 94 образцов.
К настоящему времени районы Амравати, Нагпур, Акола, Вардха, Пуна, Тане, Аурангабад и Чандрапур представили убедительные доказательства присутствия B.1.617. В других районах секвенировалось меньшее количество образцов, в некоторых был обнаружен вариант. Ожидается секвенирование дополнительных образцов.
ПРИСОЕДИНЯЙСЯ СЕЙЧАС :Телеграмм-канал The Express с объяснениями
Этот вариант более опасен?
Доказательств пока нет. Большинству пациентов подойдет домашняя изоляция, хотя клинический опыт необходимо сочетать с данными секвенирования генома для получения научных доказательств. Клинические анекдоты от врачей предполагают, что этот вариант распространяется быстрее, более заразен, может заразить целые семьи, но менее опасен и не вызывает значительно большего числа госпитализаций.
У большинства пациентов симптомы отсутствуют, и это хороший показатель. Но в абсолютных цифрах такое количество случаев стало тяжелым бременем для инфраструктуры здравоохранения, сказал д-р Шашанк Джоши, эксперт Рабочей группы Махараштры по Covid.
Насколько он распространился?
Доктор Суджит Сингх, директор Национального центра по контролю за заболеваниями (NCDC), указал, что до сих пор секвенировано очень мало образцов из Махараштры, и еще слишком рано делать окончательные выводы о том, насколько широко распространен двойной мутант. Однако центральное правительство сообщило в марте, что 15-20% образцов в Махараштре имели этот вариант; на основании последних данных секвенирования мы знаем, что сейчас это число превышает 60 процентов.
Клиницисты и районные администраторы в Махараштре сообщают, что, в отличие от первой волны, во второй волне заражаются целые семьи. Это может указывать либо на то, что меры физического дистанцирования и изоляции в домашнем хозяйстве неадекватны, либо на то, что вирус стал более передаваемым.
Может ли B.1.617 быть причиной продолжающегося роста числа случаев Covid-19?
Доктор Гангандип Канг, профессор микробиологии в Христианском медицинском колледже в Веллоре, сказал, что 60,9% образцов, несущих этот вариант, скорее всего, показали связь между мутацией и всплеском, однако для точного ответа по крайней мере 1% образцов Covid-19 необходимо чередовать каждую неделю. В настоящее время Индия тестирует более 1 миллиона случаев в день, а это означает примерно 1000 последовательностей генома каждый день.
Нам также необходимо посмотреть, сколько человек может заразить человек, и порог цикла ОТ-ПЦР. Нам нужно отслеживать в реальном времени. По словам доктора Канга, данные за январь не имеют большого значения в апреле.
Доктор Гаутам Менон, профессор Университета Ашока, Сонепат, и Института математических наук, Ченнаи, сказал: «То, что у нас есть, наводит на размышления, но нам нужно больше данных о секвенировании генома, чтобы понять, какой вариант вызывает количество новых инфекций в разных штатах…» Чтобы предположить, что рост числа случаев связан с этим вариантом двойного мутанта, у нас должно быть больше временных точек. Например, если бы мы могли сказать, что мы обнаружили 30 процентов этого варианта в образцах 30 марта, а затем 40 процентов в образцах 14 апреля, это означало бы, что новый вариант доминирует в распространении болезни.
Д-р Менон также подчеркнул необходимость большей прозрачности данных. По его словам, возможно, хотя и все более маловероятно, что эти случаи также могли быть связаны с предыдущим штаммом. Если мы не знаем, в какой степени увеличение может быть отнесено к новому варианту, мы не сможем окончательно определить, повлияло ли ослабление Covid-подходящего поведения со старым штаммом на увеличение или виновата повышенная инфекционность нового варианта.
Профессор Винод Скария, главный научный сотрудник CSIR -IGIB, согласился с тем, что мы не можем однозначно сказать, что эти варианты вызывают всплеск второй волны. Однако данные свидетельствуют о том, что, по крайней мере, в некоторых штатах линия B.1.1617 является преобладающей и может способствовать увеличению числа случаев, сказал он. Эта линия определяется 15 генетическими вариантами, включая шесть вариантов белка-шипа. По словам профессора Скарии, два из них (E484Q и L452R) участвуют в ускользании от иммунной системы, а также в повышенной инфекционности.
Может ли вариант избежать вакцинации?
Опять же, данные ограничены. Некоторые люди действительно заразились после первой дозы, но нет данных о том, были ли их образцы отправлены на секвенирование генома.
Мы знаем, что южноафриканский вариант более способен избежать иммунного ответа. Мы знаем, что британский вариант является наиболее передаточным. Но мы пока ничего не знаем о B.1.617, потому что мы не собираем данные, чтобы делать выводы, - сказал доктор Канг.
Д-р Менон подчеркнул, что, хотя вакцины не должны предотвращать инфекцию, они, безусловно, предотвращают тяжелые заболевания и смерть. Мы ожидаем, что это сохранится даже с новым вариантом. Единственное среднесрочное и долгосрочное решение борьбы с Covid-19 - это вакцинация.
ПОДЕЛИТЕСЬ С ДРУЗЬЯМИ:
