Объяснили: что такое «значение CT» в тесте на Covid-19 и почему это важно?

Пороговое значение цикла появляется в тестах RT-PCR на коронавирус и определяет, является ли человек положительным на Covid-19 или нет. В какой степени это коррелирует с вирусной нагрузкой и тяжестью заболевания?

Тест RT-PCR обнаруживает вирус; Значение Ct устанавливает критерий, определяющий, можно ли считать человека положительным. (Экспресс-фото: Амит Мехра)

Среди различных научных терминов, которые пандемия Covid-19 стала частью общедоступного словаря, одним из них является «значение Ct» в тестах RT-PCR для определения того, является ли пациент положительным на Covid-19.

Это стало предметом недавнего запроса, направленного правительством Махараштры в Индийский совет медицинских исследований (ICMR). Государство потребовало разъяснений, было ли целесообразно лечить человека как Covid-отрицательного, если значение Ct больше 24 и у человека нет симптомов. Официальные лица штата заявили, что в различных документах ICMR упоминаются разные значения Ct, и даже среди Нити Аайог и Национального центра по контролю за заболеваниями существуют разные точки зрения.

Несколько дней спустя генеральный директор ICMR ответил министру здравоохранения штата, что ICMR взял данные из вирусологических лабораторий по всей стране, чтобы прийти к единому пороговому значению Ct. Все пациенты со значением Ct менее 35 могут считаться положительными, в то время как пациенты со значением Ct выше 35 могут считаться отрицательными, сообщает ICMR.

Но каково значение Ct?

Сокращенно от порога цикла, Ct - это значение, которое появляется во время тестов RT-PCR, золотого стандарта для обнаружения коронавируса SARS-CoV-2. В тесте RT-PCR РНК извлекается из мазка, взятого у пациента. Затем он превращается в ДНК, которая затем амплифицируется. Амплификация относится к процессу создания нескольких копий генетического материала - в данном случае ДНК. Это улучшает способность теста обнаруживать присутствие вируса. Амплификация происходит через серию циклов - одна копия становится двумя, две - четырьмя и т. Д. - и именно после нескольких циклов производится обнаруживаемое количество вируса.

Согласно рекомендациям ICMR, значение Ct реакции RT-PCR - это количество циклов, при которых флуоресценция продукта PCR выявляется сверх фонового сигнала. Проще говоря, значение Ct относится к количеству циклов, после которых вирус может быть обнаружен. Если требуется большее количество циклов, это означает, что вирус не был обнаружен, когда количество циклов было меньше. Чем ниже значение Ct, тем выше вирусная нагрузка, потому что вирус был обнаружен после меньшего количества циклов.

Новостная рассылка| Нажмите, чтобы получать лучшие объяснения дня на свой почтовый ящик

Почему важно значение CT?

Чтобы поместить это в контекст, давайте посмотрим на рекомендации ICMR и письмо Махараштры в ICMR. Согласно ICMR, пациент считается Covid-положительным, если значение Ct ниже 35. Другими словами, если вирус обнаруживается после 35 циклов или раньше, то пациент считается положительным. Если бы контрольный показатель был снижен до 24 - значения, упомянутого в письме Махараштры, - это означало бы, что значения Ct в диапазоне 25-34 не будут считаться положительными. Таким образом, эталонный показатель 35 означает, что больше пациентов будут считаться положительными, чем мы получили бы, если бы эталонный показатель был равен 24. ICMR заявил, что снижение порогового параметра Ct может привести к пропуску нескольких инфекционных лиц.

По словам ведущего вирусолога доктора Шахида Джамиля, значение Ct можно рассматривать как меру потенциала передачи. «Так что, если в моем горле и носу окажется больше вируса, я передам его лучше», - сказал доктор Джамиль, директор Школы биологических наук Триведи при Университете Ашока.

Каково значение порога ICMR, равного 35?

Во всем мире принятый порог значения Ct для Covid-19 составляет от 35 до 40, в зависимости от инструкций соответствующих производителей оборудования для тестирования. ICMR пришел к значению Ct, равному 35, на основе лабораторного опыта и данных, полученных из нескольких вирусологических лабораторий.

Новых рекомендаций не было, но ICMR проинформировал правительство Махараштры, что не рекомендуется использовать параметр более низкого порога цикла, так как это приведет к пропуску нескольких инфекционных лиц и увеличению передачи заболеваний, сказал д-р Балрам Бхаргава, генеральный директор ICMR.

Есть ли корреляция между значением Ct и тяжестью заболевания?

Нет. Эксперты утверждают, что хотя величина Ct обратно пропорциональна вирусной нагрузке, она не имеет никакого отношения к серьезности заболевания. У пациента может быть низкое значение Ct, что означает, что ее вирусная нагрузка достаточно высока, чтобы ее можно было быстро обнаружить, но при этом она может оставаться бессимптомной.

Небольшое исследование, опубликованное в Индийском журнале медицинской микробиологии в январе этого года, показало, что не существует корреляции между значениями Ct и серьезностью заболевания или смертностью у пациентов с заболеванием Covid-19. Было обнаружено, что время, прошедшее с момента появления симптомов, имеет более сильную связь со значениями Ct по сравнению с тяжестью заболевания.

«Значение Ct говорит нам о вирусной нагрузке в горле, а не в легких», - сказал доктор Парикшит Праяг, консультант по инфекционным заболеваниям в больнице Динанатх Мангешкар, Пуна. Значение Ct не коррелирует с серьезностью - только с инфекционностью. В первом отчете я на самом деле не смотрю на значение Ct, но для последующего наблюдения за пациентами в больнице я действительно учитываю значение Ct, так как тогда я могу решить, переводить ли пациента в здание, не относящееся к Covid. . С точки зрения заразности это может иметь значение, а не степень тяжести, сказал доктор Праяг.

Всегда ли высокое значение Ct означает низкую вирусную нагрузку?

Хотя это может быть очевидным выводом, некоторые эксперты подчеркивают, что некоторые пациенты могут иметь высокое значение Ct, но при этом иметь очень значительный уровень инфекции Covid-19, и наоборот. Многие факторы важны для интерпретации теста RT-PCR, и результаты также могут зависеть от метода сбора образцов и времени от заражения до сбора и анализа.

В сообщении ICMR в августе прошлого года отмечалось, что значения Ct зависят от того, как был взят образец. Плохо собранный образец может отражать неподходящие значения Ct. Кроме того, значения Ct также определяются технической компетенцией человека, выполняющего тест, калибровкой оборудования и аналитическими способностями переводчиков.

Опять же, значения Ct могут различаться в образцах из носа и ротоглотки, взятых у одного и того же человека. Температура транспортировки, а также время, прошедшее от сбора до получения в лаборатории, также могут отрицательно повлиять на значения Ct.

ПОДЕЛИТЕСЬ С ДРУЗЬЯМИ: