Разъяснение: как быстро распространяется новый штамм коронавируса? Повлияет ли это на вакцинацию?

Новый штамм коронавируса в Великобритании: Индия и несколько других стран приостановили полеты в и из Великобритании. Какие мутации привели к появлению вызывающего опасения варианта коронавируса? Как быстро он распространился? И повлияет ли это на вакцинацию?

Рейсы из Великобритании отменены в аэропорту Куантрен в Женеве, Швейцария, 21 декабря 2020 г. (Фото агентства Рейтер: Денис Балибаус)

В понедельник Индия приостановил все полеты из и в Великобританию до 31 декабря, на фоне опасений по поводу новый вариант SARS-CoV-2, который быстро распространяется и растет там. Несколько других стран также приостановили полеты из Великобритании и ввели ограничения на поездки.

Что это за проблемы, ведущие к ограничениям на поездки?

На прошлой неделе было выявлено, что новый вариант SARS-CoV-2 стал причиной быстрого роста случаев заболевания Covid-19 в Южной и Восточной Англии. Он упоминается как VUI (исследуемый вариант) 202012/01 или линия передачи B.1.1.7.

«За последние несколько дней, благодаря нашим геномным возможностям мирового уровня, мы выявили новый вариант коронавируса, который может быть связан с более быстрым распространением на юге Англии», - сказал министр здравоохранения Великобритании Мэтт Хэнкок в Палате общин. 14 декабря. Власти Великобритании уже уведомили Всемирную организацию здравоохранения о своем варианте.

Служба общественного здравоохранения Англии (PHE) сообщила, что по состоянию на 13 декабря было выявлено 1108 случаев этого варианта, преимущественно на юге и востоке Англии. По его словам, PHE работает с партнерами над расследованием и планирует поделиться своими выводами в течение следующих 2 недель.

Какой вариант?

Этот вариант был идентифицирован в ходе геномного надзора COVID-19 Genomics UK (COG-UK), консорциумом, который анализирует данные секвенирования генома из Великобритании. COG-UK является крупнейшим участником глобальной базы данных по Covid-19 GISAID.

Вариант является результатом множественных мутаций в белке-шипе нового коронавируса SARS-CoV-2, а также мутаций в других геномных областях вируса РНК. Предварительный анализ показывает, что он более передается, чем ранее распространенные варианты. COG-UK идентифицировал одну из этих мутаций как N501Y в области белка-шипа, который связывается с ключевым белком в клетке человека, рецептором ACE2. Это было признаком того, что изменения теоретически могут привести к тому, что вирус станет более заразным. По словам консорциума, в настоящее время предпринимаются усилия, чтобы подтвердить, способствуют ли какие-либо из этих мутаций увеличению передачи.

Что мы знаем о трансмиссивности и серьезности заболевания?

В воскресенье PHE сообщил, что данные полногеномного секвенирования, эпидемиологии и моделирования показывают, что новый вариант передается легче, чем другие штаммы.

Тем не менее, он также подчеркнул, что нет никаких доказательств того, что этот вариант с большей вероятностью приведет к тяжелому заболеванию или смерти. … Но мы продолжаем исследования, чтобы лучше понять это, - говорится в сообщении. В нем говорится, что смертность - это запаздывающий показатель, и он будет постоянно отслеживать этот показатель в ближайшие недели.

PHE заявила, что еще не знает механизма этого увеличения передачи. Мы знаем, что мутации в спайковом белке, той части вируса, которая делает его заразным, могут изменить то, как вирус взаимодействует с клетками человека.

В нем говорится, что данные показывают, что уровень инфицирования в географических районах, где циркулирует этот конкретный штамм, увеличивался быстрее, чем ожидалось, а данные моделирования продемонстрировали, что этот вариант имеет более высокую скорость передачи, чем другие варианты, находящиеся в текущем обращении.

Новый штамм коронавируса в Великобритании: полицейский управляет движением на входе в закрытый паромный терминал в Дувре, Англия, в понедельник после закрытия порта Дувра. (Фото AP)

Насколько беспокоит более высокая проницаемость?

18 декабря Консультативная группа по новым и возникающим респираторным вирусам (NERVTAG), которая консультирует правительство Великобритании об угрозе, создаваемой новыми и появляющимися респираторными вирусами, заявила, что новый вариант потенциально может увеличить репродуктивное число болезни до 0,93. . Он заявил, что имеет умеренную уверенность в том, что новый вариант демонстрирует существенное повышение проницаемости по сравнению с другими вариантами.

Однако экспертный орган пришел к выводу, что в настоящее время недостаточно данных, чтобы сделать какие-либо выводы о механизме, лежащем в основе повышенной трансмиссивности, возрастном распределении случаев и тяжести заболевания. В нем говорится, что было выявлено 4 случая смерти из примерно 1000 случаев, но необходима дальнейшая работа, чтобы сравнить этот уровень смертности с сопоставимыми наборами данных.

Расположение мутаций в рецептор-связывающем домене гликопротеина шипа повышает вероятность того, что этот вариант антигенно отличается от предшествующих вариантов. По его словам, среди 915 субъектов с этим вариантом было выявлено четыре вероятных повторных заражения, но необходима дальнейшая работа для сравнения этой частоты повторного заражения со сравнимыми наборами данных.

В воскресенье в кратком обзоре угроз, опубликованном Европейским центром профилактики и контроля заболеваний, говорится, что филогенетический анализ показывает, что кластер отличается 29 нуклеотидными заменами от исходного штамма Ухань. Три последовательности из Дании и одна из Австралии, из образцов, собранных в ноябре 2020 года, объединяются с вариантом из Великобритании, что, скорее всего, указывает на международное распространение, хотя степень остается неизвестной, говорится в сообщении.

Новый штамм коронавируса в Великобритании: порт Дувра закрывается, поскольку страны ЕС вводят запрет на въезд из Великобритании. (Фото Рейтер)

Но разве вирус не мутировал раньше?

Всякий раз, когда вирус реплицируется и циркулирует в человеческой популяции, мутации происходят естественным образом, со скоростью примерно от одной до двух мутаций в месяц в глобальной филогении.

Фактически, в отношении SARS-CoV-2 COG-UK сообщает, что в настоящее время существует около 4000 мутаций в шиповом белке. Вариант D614G ранее был доминирующим штаммом, потому что он очень легко распространялся. Другой штамм, полученный от испанских сельскохозяйственных рабочих, - 20A. EU1 быстро распространился по Европе летом.

Трудно предсказать, насколько важна та или иная мутация, когда она впервые возникает, на фоне непрерывного появления новых мутаций. Понимание их значения может быть возможным на основе экспериментальной работы, которая показывает связь между мутацией и незначительным изменением биологии вируса. Однако, по словам COG-UK, потребуется много времени и усилий, чтобы проверить эффект многих тысяч комбинаций мутаций.

Повлияет ли это на разработку вакцины и ответные меры?

В воскресенье власти Великобритании заявили, что в приоритетном порядке проводятся дальнейшие лабораторные работы, чтобы понять это. В настоящее время нет никаких доказательств того, что вакцина Pfizer не защитит людей от нового штамма, сообщает PHE.

ПОДЕЛИТЕСЬ С ДРУЗЬЯМИ: